BaseZeissReader

This page lists supported metadata fields for the Bio-Formats BaseZeissReader.

These fields are from the OME data model. Bio-Formats standardizes each format’s original metadata to and from the OME data model so that you can work with a particular piece of metadata (e.g. physical width of the image in microns) in a format-independent way.

Of the 476 fields documented in the metadata summary table:

• The file format itself supports 84 of them (17%).

• Of those, Bio-Formats fully or partially converts 84 (100%).

Supported fields

These fields are fully supported by the Bio-Formats BaseZeissReader:

• Channel : Color

• Channel : EmissionWavelength

• Channel : ExcitationWavelength

• Channel : ID

• Channel : Name

• Channel : SamplesPerPixel

• Detector : ID

• Detector : Type

• DetectorSettings : Gain

• DetectorSettings : ID

• DetectorSettings : Offset

• Ellipse : ID

• Ellipse : RadiusX

• Ellipse : RadiusY

• Ellipse : Text

• Ellipse : X

• Ellipse : Y

• Experimenter : FirstName

• Experimenter : ID

• Experimenter : Institution

• Experimenter : LastName

• Image : AcquisitionDate

• Image : Description

• Image : ID

• Image : InstrumentRef

• Image : Name

• Image : ROIRef

• Instrument : ID

• Label : ID

• Label : Text

• Label : X

• Label : Y

• Line : ID

• Line : Text

• Line : X1

• Line : X2

• Line : Y1

• Line : Y2

• Objective : Correction

• Objective : ID

• Objective : Immersion

• Objective : LensNA

• Objective : NominalMagnification

• Objective : WorkingDistance

• ObjectiveSettings : ID

• Pixels : BigEndian

• Pixels : DimensionOrder

• Pixels : ID

• Pixels : Interleaved

• Pixels : PhysicalSizeX

• Pixels : PhysicalSizeY

• Pixels : PhysicalSizeZ

• Pixels : SignificantBits

• Pixels : SizeC

• Pixels : SizeT

• Pixels : SizeX

• Pixels : SizeY

• Pixels : SizeZ

• Pixels : Type

• Plane : DeltaT

• Plane : ExposureTime

• Plane : PositionX

• Plane : PositionY

• Plane : TheC

• Plane : TheT

• Plane : TheZ

• Point : ID

• Point : Text

• Point : X

• Point : Y

• Polygon : ID

• Polygon : Points

• Polygon : Text

• Polyline : ID

• Polyline : Points

• Polyline : Text

• ROI : ID

• ROI : Name

• Rectangle : Height

• Rectangle : ID

• Rectangle : Text

• Rectangle : Width

• Rectangle : X

• Rectangle : Y

Total supported: 84

Total unknown or missing: 392